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TransNGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina?

ATAC文庫(kù)構(gòu)建試劑盒 適配illumina平臺(tái)

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KP171-0112 rxns3960
KP171-0296 rxns28160
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產(chǎn)品詳情介紹

TransNGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina?是針對(duì)Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)開(kāi)發(fā)的,適用于普通哺乳動(dòng)物細(xì)胞的ATAC文庫(kù)構(gòu)建試劑盒,所得文庫(kù)可用于單端或雙端測(cè)序。該試劑盒采用新型的轉(zhuǎn)座酶技術(shù),針對(duì)染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域建庫(kù)測(cè)序,僅需3個(gè)小時(shí)即可完成實(shí)驗(yàn)。所需細(xì)胞量少,10-50000細(xì)胞的起始量均可以獲得高分辨率的測(cè)序圖譜。

產(chǎn)品組成

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實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)

文庫(kù)產(chǎn)量高


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對(duì)3種哺乳動(dòng)物細(xì)胞以50,000、10,000 cells為起始細(xì)胞投入量進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建。結(jié)果表明, TransGen產(chǎn)品針對(duì)不同細(xì)胞及投入量,均可構(gòu)建高產(chǎn)量文庫(kù)。


細(xì)胞起始量低

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對(duì)不同細(xì)胞投入量(50-1,000 cells)的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建,不同細(xì)胞投入量的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)如上表。結(jié)果表明,TransGen產(chǎn)品可用于構(gòu)建低起始量(50個(gè)細(xì)胞)的ATAC文庫(kù),文庫(kù)產(chǎn)量高,峰型好。


與競(jìng)品比較

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分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對(duì)不同細(xì)胞投入量(5,000-50,000 cells)的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建。結(jié)果表明,TransGen產(chǎn)品的文庫(kù)產(chǎn)量、文庫(kù)峰型與競(jìng)品相比,優(yōu)于競(jìng)品。


下機(jī)數(shù)據(jù)好

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對(duì)不同細(xì)胞投入量(50-50,000 cells)的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建,將構(gòu)建后的文庫(kù)測(cè)序,下機(jī)后進(jìn)行生信分析。結(jié)果表明,TSS富集圖顯示在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)周?chē)患黠@,IGV視圖顯示ATAC在關(guān)鍵位點(diǎn)與H3K4me3基因的ChIP-seq結(jié)果一致,實(shí)驗(yàn)結(jié)果真實(shí)可靠。


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